天花并發(fā)癥多發(fā)生于重型患者。一般為繼發(fā)性細菌感染，常為金黃色葡萄球菌、溶血性鏈球菌及肺炎球菌等。可發(fā)生蜂窩織炎、軟組織膿腫、結(jié)膜炎、角膜潰瘍、全眼球炎、中耳炎、喉炎、支氣管肺炎、胸膜炎等。個別可并發(fā)腦脊髓炎、腎炎、睪丸炎、流產(chǎn)、褥瘡等。
典型天花患者往往留下終身存在的凹陷瘢痕，尤其以面部較明顯，導致毀容，俗稱“麻面”，往往對患者造成嚴重的心理打擊。角膜潰瘍、全眼球炎則可能導致患眼失明。